بتمن و متحدانش که اوایل لاک‌پشت‌های نینجا را دشمن خود می‌دانند، پس از مدتی با آنها گروهی را تشکیل می‌دهند تا به نبردی سخت با شردر ، راس‌الغول و انجمن سایه‌ها بروند و…