کارگردان، تهیه‌کننده و فیلم‌نامه‌نویس اهل اسپانیا است. وی از سال 1999 میلادی تاکنون مشغول فعالیت بوده است.خوان از شاگردان گیرمو دل تورو است و فیلمهایش هم حال و هوای فانتزی تاریک در تورو را دارد.از جمله فیلمهای بایونا میتوان به غیرممکن و یتیم‌خانه و هیولایی فرا می‌خواند و دنیای ژوراسیک 2 اشاره کرد.